31 Mayıs 2018 Perşembe

Veriye dayalı karar verme

"Data driven decision making" bu kavramı Türkçe'ye nasıl çevirebiliriz. Veri bazlı karar verme, veriye dayalı karar verme ?? Emin olamadım.

Bizde genelde kararlar bazı "norm"lara göre alındığı için veriye dayalı karar verme genelde geri plandadır. Bu düşünce sisteminin yerleşmesi epey zaman alacak gibi duruyor.

Veri'nin kainattaki olanlara ait bir bilgi (birer ayet) olduğunu anlamak ve bunun üzerine fikir üretmek (tefekkür) de epey zaman alacağa benzer.

Bu konu oldukça güncel ve bununla ilgili eğitimler de var: https://www.coursera.org/learn/decision-making

Şimdi bu mevzu niye mi aklıma geldi. Son zamanlarda "Uber ve taksi" meselesinde "veri"ye dayalı değil de "norm"lara dayalı tartıştığımızı şu aşağıdaki grafiği görünce farkettim.

Kim bilir belki gün gelir biz de kendi verilerimizle bu grafikleri çizeriz.



Copied from Uber overtakes taxis in New York City
https://blog.revolutionanalytics.com/2018/04/uber-overtakes-taxis-in-nyc.html
In an update to his analysis of taxi and ride-share trips, Todd Schnieder reports that the number of daily Uber rides exceeds the number of taxi rides in New York City, as of November 2017.






Data Driven Decision Making (D3M)

http://www.vishalsingh.org/teaching/




28 Mayıs 2018 Pazartesi

Tekrarlanabilir ve otomatik raporlar

Şöyle birşey düşünün,

Pankreas patolojisi ile ilgileniyorsunuz. "Bizim pankreas serisi ne durumda" diye merak ettiniz. Yaptığınız şey birkaç düğmeye basmak, ve o zamana kadar bölümünüzde rapor edilen pankreas vakalarının yaş, cinsiyet, tümör çapı, tümör tipi, evre, derece, lenf nodu durumu vesair bilgileri sağ kalım grafikleri ile word dökümanı olarak oluşturuluveriyor.

Bu hayal değil. Yapılabilir.

Makul bir bilgi işlem çalışanı, CAP ve AJCC'ye uygun doldurulması zorunlu yapılandırılmış patoloji raporları, ana veri tablosuna erişim, biraz SQL, biraz R, biraz da R Markdown kullanarak bunu yapmak işten bile değil.



Branding and automating your work with R Markdown – RStudio


Genetik sonuçlarıyla da entegre edelim madem o kadar istiyorsunuz :)

7 Mayıs 2018 Pazartesi

Onkolog için mektup



Sayın onkologlar,
Lütfen hastalarınıza "çok geç kalmışsınız" demeyin. "Hastalık ilerlemiş" deyin. İlkinde "hasta (ve yakını)" suçlu hissederken, ikincisinde kötü karakter "hastalık" oluyor.
Zaten yeterince suçlayan var, bir de siz suçlamayın.
Teşekkürler




Sayın Onkologlar,
Yine ben...
İlaçların gerçekten akıllı ya da akılsız olduklarını mı düşünüyorsunuz?
Test sonucumu bana her anlattığınızda "ne yani benim ilacım gerizekalı mı" diye soruyorum ben de.
Neyse, bence bu moleküler testleri "akıllı ilaç şansı" için yapmaktan vazgeçip "uygun ilacı tespit etmek" için istemeye başlarsanız daha iyi olacak.
Ne de olsa o çok akıllı ilaçlardan birinin keratinli bir tümör varlığında hastaya neler yaptığını gayet iyi biliyoruz.
Selamlar



6 Mayıs 2018 Pazar

StackOverFlow kitap haline dönüşürse

StackOverFlow'da yazılan yazıların derlemesi ile kitaplar oluşturulmuş:

Programming Notes for Professionals books
https://goalkicker.com/

Kitaplar yeni gönderilerle güncelleniyormuş.

Ben R için olan kitaba hızlıca baktım:
https://goalkicker.com/RBook/

Bence dizayn ve içerik olarak gayet güzel olmuş.


4 Mayıs 2018 Cuma

Pankreas Intraduktal Papiller Müsinöz Neoplaziler (IPMN) semineri

MSKCC'de düzenlenen alumni toplantısında sunulan pankreas IPMN semineri

2016 MSK Alumni Conference - Olca Basturk, MD
"Intraductal Papillary Mucinous Neoplasm of the Pancreas"
MEMORIAL SLOAN KETTERING ALUMNI SOCIETY



1 Mayıs 2018 Salı

Biraz SPSS, biraz Excel, biraz R : BlueSky Statistics

İstatistik için ücretsiz bir program arıyor, biraz SPSS'e benzesin, biraz Excel, biraz da R olsun diyorsanız BlueSky Statistics'i bir denemenizi öneririm:

http://www.blueskystatistics.com/



  • Overview of BlueSky Statistics





  • Getting Started with BlueSky Statistics






  • Model fitting and scoring with BlueSky Statistics







  • KNN with BlueSky Statistics



  • Market Basket Analysis and Associate rules with BlueSky Statistics



  • Using dialog editor to create dialogs and richly formatted output with BlueSky Statistics



  • Creating more sophisticated dialogs with dialog editor





  • Creating a dialog for a data manipulation command with BlueSky Statistics





  • Creating a dialog for a graphics command with BlueSky Statistics