graph TD
POLIKLINIK[Poliklinik] --> HASTANETRANSFER[Hastane Transfer]
HASTABASI[Hasta Başı] --> HASTANETRANSFER[Hastane Transfer]
FROZEN[Frozen] --> AMELİYATHANE[Ameliyathane]
AMELİYATHANE[Ameliyathane] --> HASTANETRANSFER[Hastane Transfer]
HASTANETRANSFER[Hastane Transfer] --> PATOLOJIKABUL{Patoloji Kabul}
PATOLOJIKABUL{Patoloji Kabul} --> MAKROSKOPİ[Makroskopi]
MAKROSKOPİ[Makroskopi] --> MAKROSKOPIARSIV[Makroskopi Arşiv]
MAKROSKOPIARSIV[Makroskopi Arşiv] --> TIBBIATIK[Tıbbi Atık]
MAKROSKOPİ[Makroskopi] --> DOKUTAKIP[Doku Takip]
DOKUTAKIP[Doku Takip] --> GOMME[Gömme]
GOMME[Gömme] --> KESIT[Kesit]
TESLIMATDP[Teslimat ya da Dijital Tarama] -..-> ARSIV[Lam/Blok Arşivi, Dijital Arşiv]
KESIT[Kesit] --> HE[Rutin Boyama HE]
HE[Rutin Boyama HE] --> TESLIMATDP[Teslimat ya da Dijital Tarama]
TESLIMATDP[Teslimat ya da Dijital Tarama] --> PATOLOG{Patolog}
PATOLOG{Patolog} --Mikroskopi--> RAPOR(Rapor)
RAPOR(Rapor) -.Ek Rapor.-> RAPORARSIV[Rapor Arşivi]
RAPORARSIV[Rapor Arşivi] -..- RESEARCH[Araştırma, Konsültasyon]
ARSIV[Lam/Blok Arşivi, Dijital Arşiv] -..- RESEARCH[Araştırma, Konsültasyon]
PATOLOG{Patolog} -.Yeni Parça.-> MAKROSKOPİ[Makroskopi]
PATOLOG{Patolog} -.Yeni Kesit.-> KESIT[Kesit]
KESIT[Kesit] -.Histokimya.-> TESLIMATDP[Teslimat ya da Dijital Tarama]
KESIT[Kesit] -.İmmünohistokimya.-> TESLIMATDP[Teslimat ya da Dijital Tarama]
KESIT[Kesit] -.FISH/CISH.-> TESLIMATDP[Teslimat ya da Dijital Tarama]
KESIT[Kesit] -.Genetik.-> PATOLOG{Patolog}
PATOLOG{Patolog} -.Konsültasyon.- DIGERPATOLOG[Diğer Patolog]
PATOLOG{Patolog} -.Konsültasyon.- DIGERHASTANEPATOLOG[Diğer Hastanedeki Patolog]
RAPOR(Rapor) --- KLINISYEN[Klinisyen]
RAPOR(Rapor) --- KLINIKOPATOLOJIK[Klinikopatolojik Toplantı]
PATOLOJIKABUL{Patoloji Kabul} --> SİTOLOJİ[Sitoloji]
SİTOLOJİ[Sitoloji] --> DOKUTAKIP[Doku Takip]
SİTOLOJİ[Sitoloji] --> TESLIMATDP[Teslimat ya da Dijital Tarama]
Mühendisler ve Hekimler Ortak Bir Dili Nasıl Kurar?
Patologdan Mühendislere
2025-10-18
Patoloji İş Akışı ve Yazılım İhtiyacı
Metin Verisi: Yapılandırılmış, Serbest Metin
Metin Verisi: Yapılandırılmış, Serbest Metin
Metin Verisi: Yapılandırılmış, Serbest Metin
Metin Verisi: Yapılandırılmış, Serbest Metin
Metin Verisi: Yapılandırılmış, Serbest Metin
ECDP 2024
Görüntü Kalitesi
- Artefakt
- Kıvrımlar
- Bulanıklık
- Kalem işaretleri
- Hava kabarcıkları
- Tarama kalitesi
- Kamera, Işık
- Odak
- Tarama zamanı (hemen vs arşiv)
- Patolog
- Yapay zeka
- GrandQC
Anonimleştirme
svs
dicom
PMID: 40979690 Wearing a fur coat in the summertime: Should digital pathology redefine medical imaging?
PMID: 40933626 Raining on the WSI interoperability parade - incorrect assertions with respect to DICOM and fur coats in the summertime
Anonimleştirme
PACS’tan aktarırken
Annotasyon, İşaretleme, Etiketleme
PMID: 36788085 Annotating for Artificial Intelligence Applications in Digital Pathology: A Practical Guide for Pathologists and Researchers
PMID: 39615882 Annotation Practices in Computational Pathology: A European Society of Digital and Integrative Pathology (ESDIP) Survey Study
Annotasyon, İşaretleme, Etiketleme
Annotasyon, İşaretleme, Etiketleme
sbalci/sectra-qupath Using Sectra PACS Annotations in QuPath: A Comprehensive Guide
Arayüz
- Araştırma için tasarlanmış arayüz
- Anotasyon
- Geri bildirim
- Model entegrasyonu
- caMicroscope
- OMERO.web
- Digital Slide Archive (DSA)
Değerlendirme ve Yorumlama
- Model bize ne kadar bilgi veriyor.
- Model bize rutin pratiğimizde yol gösterici olabilir mi?
- HPV ya da EBV varlığını tespit ettiğini idda eden model aslında sadece morfolojiyi mi tespit ediyor?
- ER pozitifliğini tespit eden model aslında sadece tümör diferansiyasyonunu mu tespit ediyor?
Değerlendirme ve Yorumlama
